Свои двери школы впервые распахнула в 1938 году. Но уже через три года началась Великая Отечественная война, и первые юные выпускники отправились на фронт, а в самом здании был развернут военный госпиталь. Тогда многие пали смертью храбрых. Их имена сохранила до наших дней мемориальная доска, которая размещена на школе.
После победы над фашистами в школе возобновились занятия, и все последующие годы до нынешнего времени здесь учат и воспитывают детей. В 2006 году СОШ № 6 стала первым пунктом в Подольске, где состоялась апробация Единого государственного экзамена. ⠀
Среди именитых выпускников школы заслуженный учитель Российской Федерации, почетный гражданин Подольска, директор Лицея № 1 Вера Либкина, а также учитель русского языка и литературы Олеся Честных. Олеся Евгеньевна стала лауреатом Всероссийского конкурса профессионального мастерства для молодых педагогов «Педагогический дебют». Она же в 2020 году вошла в пятерку лучших учителей в конкурсе «Учитель года Подмосковья», который проходит при поддержке Министерства образования Московской области.
