Во время своей предвыборной кампании Милей неоднократно обрушивался на понтифика с критикой. Он называл его «представителем зла на Земле». Будущий аргентинский лидер обвинял Франциска в том, что он поддерживает «коммунистов» и «левые режимы» во всем мире. Также он пенял папе римскому на то, что тот считает своим главным делом решение социальных вопросов, а «это очень сложно».
Хорхе Марио Бергольо, взошедший на папский престол в 2013 году, стал первым в истории понтификом из Америки. Аргентина остается в массе своей католической страной, и папа пользуется там огромным уважением.
Хавьер Милей после своего избрания изменил риторику по отношению к религии и иерархам. Он заявил, что теперь выполняет функции лидера всех аргентинцев и должен соблюдать их интересы.